コロナ 遺伝子変異。 やっぱりウイルスは遺伝子操作されていた!

ウイルスの特徴に関する論文

コロナ 遺伝子変異

point• 新型コロナウイルスの遺伝指紋が調べられ、17の型を特定• 日本には既にヨーロッパ型の変異体が入り込んでいることが判明• ウイルスの変異速度は加速度的に増し、型どうしの内戦が勃発している可能性も に対する最新の遺伝分析が完了しました。 では、コロナウイルスは既に3つの型に変異しており、爆発的な感染が起きているヨーロッパではウイルスの新型変異体(C型)が関与していることが示唆されました。 ですが今回、4月に入って行われた新しい分析によって、ウイルスはアメリカ上陸後も独自の変異を遂げていることが判明。 また 日本国内においては、これまで主流だった東アジア型以外にも、イタリアやイギリスでみられていたヨーロッパ型が入り込み、拡散しはじめていることが明らかになりました。 これは、東アジアからヨーロッパに拡散したウイルスが、ヨーロッパ人の観光客などに紛れて、日本にUターンしていることを意味します。 一方、中国をはじめとした初期に強い封鎖措置がとられた国では、ヨーロッパ型のウイルスの「Uターン現象」はまだ検出されていません。 その結果、本手法においてはコロナウイルスに17の型が存在することが明らかになりました。 上の画像では、各国で検出されたそれぞれの型の割合を示しています。 緑~茶色系の色が東アジアでみられる型で、オレンジ~赤が主にヨーロッパでみられる型です。 日本と同じヨーロッパ型の変異が確認された国は、イギリス・アイスランド・ベルギー・オランダ(ネーデルランド)・イタリア・ドイツ・ブラジル・カナダなどがあげられます。 これは東アジアからはじまった感染がヨーロッパを巡り、日本へUターンしてきたということでしょう。 初期において強い封鎖が行われていた中国などでは、このようなUターン現象はみられませんでした。 同じコロナウイルスでも、地域によってかなり変異体のばらつきがあることがわかります。 日本でも、東京都それ以外の地域で流行している変異体には違いがあるのかもしれません。 アメリカでは初期は東アジア型が優勢でしたが、時間と共に東アジア型が駆逐され、アメリカ独自型とヨーロッパ型が支配的な地位を占めるようになりました。 通常、このような比率の変動は、隔離措置などによる人為的な影響(選択圧)、もしくはウイルスどうしで競争が行われ、強いものが弱いものを駆逐した場合にみられます。 もしアメリカ型(青)やニューヨークの主流であるヨーロッパ型(黄色に近いオレンジ)に他とは異なる強い感染力がある場合、特に強い警戒を要する型になるでしょう。 上のグラフの左の軸は、ウイルスがオリジナルから変異した量を日数ごとに白丸で示しています。 グラフから、新型コロナウイルスはより効率的な感染能力を求めて自分を変異させ続けている様子が読み取れます。 そしてアメリカで東アジア型が衰退したように、 現在はウイルスのサブグループ(型)どうしでのような状況が発生しています。 ウイルスは、他の型によって患者が死んだり免疫が生じたりする前に、自分の型を感染させて増やさなければ生き残れないからです。 ですが、もしかしたら、このウイルスどうしの内戦に人類の付け込む余地があるかもしれません。 というのも「感染しても無症状になる型」がウイルスどうしの内戦に勝利した場合、それは人類にとっても勝利と言えるからです。 ですが特定の型に援助を行い「ウイルスをもってしてウイルスを倒す」戦略は、つまるところウイルスとの共存です。 人類が新薬をもって、一撃のもとにウイルスを絶滅させる…。 そんな夢のような未来を信じている人もいるかもしれませんが、ウイルスの変異速度を考えると難しいと言わざるを得ないでしょう。 この研究内容の詳細はアメリカ、ドレクセル大学のZhengqiao Zhao氏らによってまとめられ、4月7日に学術雑誌「」に掲載されました。

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新型コロナウイルスの流行状況を遺伝子配列データをもとに分析したNextstrainのレポートの日本語版が登場

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「欧州株の分布は驚くべき速さで増す」 [ロンドン発]新型コロナウイルスの変異について米ロスアラモス国立研究所は4月29日、スパイクタンパク質における14の変異を特定し、その中の1つの変異株(D614G、いわゆる欧州株)が2月初めから欧州で感染拡大し、世界中に広がったと指摘するを発表しました。 論文は「D614Gの分布は驚くべき速さで増しており、もとの武漢株と比較してより迅速に拡散できる適応度の優位性を示している」と分析しています。 筆頭著者のベティ・コーバー氏はフェイスブックにこう書いています。 「新興ウイルスが非常に速く広がり、3月にはパンデミックの支配的な株になったことを見ると心配だ。 この変異株が流行し始めると、それまでにその地域で広がっていた株に取って代わる。 D614Gの感染力は強い」 コロナウイルスは表面に他のウイルスとは異なる「王冠(コロナ)」のような突起(スパイク)を持っています。 この突起はスパイクタンパク質から成り、標的となる細胞表面の受容体(レセプター)結合と細胞侵入の中心的な役割を果たしています。 新型コロナウイルスのスパイクタンパク質はヒトの上気道や肺、腸などの上皮細胞表面にある酵素ACE2にひっつきます。 今回の研究論文はそのスパイクタンパク質の変異をゲノム情報から解析したものです。 ロスアラモス国立研究所は世界中の患者6346人から採取された新型コロナウイルスのゲノム情報を解析。 その結果、スパイクタンパク質の14の変異を特定し、欧州で被害を広げたD614Gが他の地域でも最も優位的な変異株になっていることが分かりました。 新型コロナウイルスの変異株が非常に急速に出現して、感染力が強いため優位的に広がったことを示唆しています。 査読前論文なのでスパイクタンパク質の変異が感染力や病原性の違いにどのような影響を与えるのか、もう少し待たないと確かなことは言えません。 スパイクタンパク質はワクチンの重要なターゲットであるため、速い変異はワクチン開発にも大きな影響を与えます。 欧州株に感染した患者はウイルス量が多いようですが、入院率で見た場合、武漢株と欧州株には大きな差がなかったようです。 しかし武漢株に感染して抗体ができたとしても欧州株に感染するかもしれません。 流行の主流となった武漢株(オレンジ色)と欧州株(青色)の流行を観察したのが下のグラフです。 ロスアラモス国立研究所の査読前論文より 日本はもう少しで欧州株の流行をシャットアウトすることができそうです。 安倍晋三首相が国家緊急事態宣言を今月末まで延長したことに対する批判が日本では渦巻いていますが、筆者は勇断だと思います。 欧州株は武漢株より感染力が強いので一段の警戒が必要だからです。 もたもたしているように見えるのは日本が自由民主主義国家である証明です。 これまでに発表されている主な研究論文をおさらいしておきましょう。 2月21日「新型コロナウイルスに5つのグループ」 中国科学院西双版納(シーサンパンナ)熱帯植物園の研究者、郁文彬(Wen-Bin Yu)氏らの 研究班がグローバルイニシアチブ(GISAID)に登録された93のゲノム情報を分析しという論文を発表。 郁文彬氏らの論文より ChinaXivに査読前論文として掲載され、正式受理は4月27日。 それによると58のハプロタイプ(半数体の遺伝子型、塩基の組み合わせ)が確認され、5つのグループに分類できたそうです。 同 上のウイルスの家系図(系統樹)にあるH13やH38が新型コロナウイルスの先祖ハプロタイプとみられ、後に中継ぎハプロタイプのH3からH1が枝分かれしたとみられています。 塩基の数も2万9782個から2万9903個とばらつきがありました。 塩基の一つ一つは「文字」のようなもので、この組み合わせがタンパク質を構成するアミノ酸という「単語」を作り出します。 こうした単語が集まって新型コロナウイルスという短編小説を織りなします。 日本の国立感染症研究所(感染研)によると、新型コロナウイルスは一本鎖プラス鎖RNAウイルスで全長29. 9 キロベース(kb)。 塩基1個を1b(ベース)と表すので29. 9kbとは29. ウイルスが増殖する時、遺伝情報をコピーしますが、この時、文字(塩基)を写し間違えてしまうことがあります。 これが変異です。 新型コロナウイルスには、こうしたミスプリを見つけて文字を切り取って正しい文字に置き換える校正機能(Viral Proofreader・NSP14)が備わっています。 しかしミスプリは完全には防げないようです。 文字(塩基)が1つだけ入れ替わっても作られる単語(アミノ酸)が同じ場合、構成されるタンパク質は変わらず、短編小説のストーリーは全く変わりません。 自動車のボディーがいくら傷ついても、そのモデル自体、エンジンやハンドルの機能が変わらないのと同じです。 ウイルスにとってミスプリはサバイバルのために欠かせない現象です。 生存していくためには環境に適応できるようアミノ酸の配列を変える必要があるからです。 たとえば58のハプロタイプや5つのグループがあったとしても宿主の免疫力や環境によって淘汰され、消滅を免れるのはその一部です。 3月3日「新型コロナウイルスにL型とS型」 北京大学のXiaolu Tang氏らの研究班がという論文をオックスフォード・アカデミックのナショナル・サイエンス・レビューに発表しています。 新型コロナウイルスのゲノム情報はコウモリや、ウロコで覆われた希少な哺乳類センザンコウを宿主とするウイルスに近いことを指摘。 新型コロナウイルスの2つの主要なタイプであるL型とS型に進化しており、L型が7割以下、先祖に近いS型は3割以下で、L型の方が普及していると分析しました。 当初、論文の中で、L型が普及していることから 「L型の方が、感染力が強い可能性がある」と指摘していましたが、誤解を招くという批判を受け「(S型より出現の)頻度が高い」と修正しました。 4月8日「新型コロナウイルスにA、B、Cの3タイプ。 誕生は昨年9月13日~12月7日」 英ケンブリッジ大学のピーター・フォスター博士らの研究チームはなどで「ウイルスは3つに大別でき、コウモリから人間に感染したのは9月13日から12月7日の間」との見方を示しました。 GISAIDで共有されている160人分の新型コロナウイルスのゲノムを遺伝的ネットワーク手法で分析したところ3つの型に大別できたそうです。 (A型)アウトブレイクの根源。 中国雲南省のコウモリやセンザンコウから検出されたウイルスに最も近い。 今回のパンデミックのエピセンター(発生源)とされる中国湖北省武漢市でも見つかったが、武漢市で流行したのはB型。 アメリカやオーストラリアの患者からも派生したA型が見つかる。 (B型)A型から変異。 武漢市を中心に中国や近隣諸国に蔓延。 「B型は免疫学的または環境的に東アジアの人口の大部分に適応する可能性がある」(フォスター博士)。 (C型)B型から変異。 イタリア、フランス、スウェーデン、イギリスの初期の患者にみられる主要な欧州型。 初期の中国本土のサンプルからは見つからなかったが、シンガポール、香港、韓国では検出されている。 4月14日「アイスランドで流行する7つのハプロタイプ」 アイスランドで陽性と確認された1221人のウイルスのゲノム情報を解析した結果、大まかに分けてしていることが判明。 アイスランドの研究論文より 4月14日「感染力も毒性も突然変異する新型コロナ『強毒種は270倍のウイルス量』中国の研究」 で、浙江省杭州市で1月22日~2月24日に無作為に選ばれた患者11人から取り出した新型コロナウイルスをサル由来のベロ細胞に感染させ、分析した結果を報告。 それによると、33を超える変異を確認。 そのうち19は全く新しいものでした。 感染時の宿主細胞への結合に不可欠なスパイク糖タンパク質で6つの異なる変異が起きていました。 ベロ細胞内のウイルス量は最大で270倍も異なり、ウイルス量の多い細胞はすぐに死にました。 変異により病原性が大きく変化し、強毒性の種が生まれることが実験で初めて確認できたそうです。 英王立化学会の「化学の世界」のコラムニスト、は「新型コロナウイルスの遺伝情報の中のORF7bが変異していた患者は45日間も陽性だった。 こうした変異が患者の回復の遅れとどんな相関関係があるのか調べてみる価値はある」と述べています。 これに対して近畿大学医学部の宮澤正顯教授は「それぞれの点突然変異が対応する構造タンパク質や非構造タンパク質にどのような機能変化をもたらしているかも全く明らかでなく、本当にその変異でウイルスタンパク質の機能が変わるのか、何の証拠もない」と指摘されています。 4月27日「新型コロナは14日ごとに変異 感染研が分析 武漢株より怖い欧州株を食い止められるか」 新型コロナウイルスの患者5073人から採取されたウイルスのゲノム情報を解析した結果、1年間で25. 9カ所に塩基変異が起きると推定されることがで分かりました。 単純計算で平均14日に1度のペースで変異していることになります。 感染研の報告書より 1月初旬に武漢市で発生したウイルス株(武漢株)を基点に日本各地に初期のクラスターが複数発生したものの、すでに消失へと転じていることを確認。 中国経由の第一波を封じ込めたものの3月中旬以降、欧米経由の第二波(欧州株)の輸入症例が国内で広がっている恐れが強いと指摘しました。 うちA2a(いわゆる欧州株)が全ての地域で支配株に」と指摘する論文をインド医学研究評議会(ICMR)の医学雑誌に発表するとが報道。 A2aが世界中で支配的(50. 主な内訳は次の通りです。 A2aタイプ 1848個 O 582個 B1 505個 (おわり).

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新型コロナウイルスはヨーロッパへ広がるために変異していた?ウイルスの系譜が明らかに

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・3月27日の USAトゥディより。 絶え間ない変異 新型コロナウイルスに「複数の株」が存在していることは知られていましたが、公式な報道では「 2種類の株」というようなことが報じられることが多かったのですけれど、数日前のアメリカの USA トゥディで、新型コロナウイルスの比較的正確な遺伝子解析を参照した記事があり、そこには、 「新型コロナウイルスは 8種の異なる株の系統に分岐している」 ことが示されていました。 これは、病原体の進化をリアルタイムで追跡している「ネクストストレイン()」というプロジェクトによるもので、2019年12月から現在までの新型コロナウイルスの変異と分岐の状況は以下のようになっています。 全部で、2499の新型コロナウイルスのゲノム・サンプルが示されています。 2019年12月から2020年3月までの新型コロナウイルスの遺伝子の変異と分岐 ・ ドットの色分けは、それぞれの株の流行している国や地域を示します。 日本を含む東アジアは、紫色となります。 ・ 2019年12月時点から見ますと、2020年3月には、系統が 8つにわかれ、それぞれの国や地域で流行している株が異なる場合があることがわかります。 これを見ますと、2019年12月03日という、まだ中国の武漢でも大きな感染拡大が起きていなかった頃に、「 すでに 5種の株があった」ことがわかります。 これについては以下の記事で、カナダのグローバルリサーチの記事で「新型コロナウイルスには、発生源が 5カ所ある」ことにふれています。 参考までに、その記事から抜粋します。 武漢を含めた中国のほとんどと、台湾と韓国、タイとベトナム、シンガポールとイギリス、ベルギーとドイツなどでは、1つのタイプの感染しか起きていない。 なので、他のハプロタイプはアメリカで生まれた可能性がある。 上記のテストにはイランもイタリアも含まれていないが、イランとイタリアは、現地で流行しているゲノムを解読し、中国のものとは異なるタイプであることを確認した。 つまり、イランとイタリアのコロナウイルスのタイプは、中国からではなく、別の感染源から導入されたものといえる。 イタリアのタイプは中国とほぼ同じ致死率を持ち、他の国の 3倍の致死率を持っているが、イランのタイプは致死率が 10%から 25%の間であり、最も致命的であるように見えることは注目に値する。 さきほどの図を見ますと、アジアとヨーロッパ、アメリカで流行している株は、基本的に異なる部分が多いようで、「新型コロナウイルスのアウトブレイク」とはいっても、場合によっては、「違う病気のような症状と深刻度」が示されていることもありそうです。 ・ これを見ますと、先ほどのカナダ・グローバル・リサーチの記事に書かれてあることがある程度正しいことがわかります。 以下の部分です。 >台湾の科学者は、その既知の 5つの株すべてをアメリカだけが持っていることを実証 アメリカは「赤いドット」で示されていますが、上から下までの 8種類すべての株に赤いドットが表示されています。 その点、東アジアの色分けとなっている「紫」は、上のほうの株では、ほぼ示されていないようで、少なくとも現時点では、基本的には、 「ヨーロッパで流行している一部の株は、日本や韓国などでは流行していない」 ということが言えそうで、しかし、下のほうの、つまり中国で流行していた 2019年からある株(主に、日本や東アジアで流行している株)は、時間が経つにつれて、ヨーロッパにも拡大していることもわかります。 つまり、現在のヨーロッパは、 「中国の当初からの株と、分岐した後の株と、両方が流行している」 ようです。 イタリアの致死率が異常に高いのも、「株の種類」と関係あるのかもしれません。 イタリアの致死率は、4月1日に「 11. さらには、上の図を見ていますと、どんどんと新型コロナウイルスの遺伝子が変異している中では(小さな変異は 100以上見出されているそうです)、さらに分岐して、 今後も「新しい系統」が生まれ、「新しい株」が数多く発生していくことになると思われます。 ここで、「うーん・・・」と考えてしまいます。 たとえば、前回の記事「」では、私は「移動制限」や「国家封鎖」は、あまりにも後のマイナスの反動が大きすぎて、国家を破壊してしまうのではないかという心配があるというようなことを書きました。 しかし、「 新型コロナウイルスの新しい株が次々と出てくる」ことになった場合、あるいは、すでにイタリアやスペインなどで流行している 「致死性のとても高い株」などが他の国や地域に拡大していくというのは厄介なことです。 以下は、先ほどのネクストストレインの、どのように新型コロナウイルスの系統樹が各国に広がっていったかを示します。 ・ 感染が世界中に拡大するにつれて、変異と分岐も広がっていきます。 イタリアやスペインで流行している株が、もし、今後さらに強い病原性を持つようになる場合があるとすれば、そういうものの流入は確かに避けたいところでもあります。 それを防ぐには、国境封鎖を続けるしかないのでしょうか……。 いったい、このパンデミックの終着点がどのあたりにあるのか、まるでわからなくなってきている状況といえます。 USA トゥディは、科学者の言葉の引用として 「まだ私たち科学者が見逃している株の系統がたくさんあるはずだ」としていましたが、今後も株は増加し続けていくということになりそうです。 治療薬やワクチンの開発の難しさも、この変異と分岐の多彩さにあるのかもしれません。 基本的にはコロナウイルスでも、各国で流行しているタイプは、それぞれ、かなり異なったものとなっている可能性があり、世界全体で使用できるタイプの薬剤の開発は難しそうです。 これからも対応が困難な状況が続いてしまうのかもしれません。 どうすれば打開の道筋が見えるのか、まるで見当もつかない状況です。 ブログではあまりふれにくいことなどを含めて、毎週金曜日に配信させていたただいています。 お試し月は無料で、その期間中におやめになることもできますので、お試し下されば幸いです。 されるか以下のバナーからご登録できます。

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